蜈蚣的自然敌害较多，若无良好的防御适应能力，就很难生存，发展其种族，蜈蚣在自然界始终是一个庞大的优势类群，其主要原因，在于它具有许多防御敌害的性能。

蜈蚣都有强大的蟞足和毒腺，是捕食和攻击敌害的武器，而且蜈蚣善于伪装隐压，许多蜈蚣常躲于伪装的洞穴之内，或枯枝残叶，食物碎片堆成的隐体物中，掩护自己，不易被敌害发现，如欧洲的石娱蛀常年栖息于洞穴巾，再就是蜈蚣在受到敌害威胁时，便从毒腺里发射出能驱逐敌害的烟雾，以使对方不故接近，而蜈蚣自己便溜之大吉，潜穴而居也是蜈蚣御敌和渡过外界不良环境的一种方式。潜居于山地的热带蜈蚣，当敌害侵犯时，能迅速躲藏到山溪潮湿阴暗的岩石洞内深处，地蜈蚣遇到敌害浸袭时，凭借着细长的身体，穿过土壤或植物碎片，钻到土层深处。

蜈蚣穴居的深度，随季节的变化而有所不同，夏秋季节气候温暖，潜伏较浅，冬季寒冷，潜居较深。